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PCR 實驗室污染情況詳細分析

        PCR實驗室又叫基因擴增實驗室,PCR是一種的生物學檢測技術,是基因檢測的一種手段,具有高度敏感性、特異性、快速、簡便等特點已經被廣泛應用,不過正是由于它靈敏度極高,極微量的污染源都有可能導致檢測結果的假陽性,因此所有的預防措施都會稍稍有所不同?!敢撞椴灰撞臁梗廴緛淼们臒o聲息,PCR 實驗室污染具體分析如下:

 

一、PCR 實驗室污染分類:

 

1、 樣本間交叉污染

主要是在采(?。拥倪^程中,由于取樣工具之間的交叉造成污染;或者在核酸提取的過程中,由于移液器、離心管等使用不當導致的污染。

2、 PCR試劑污染

主要是在 PCR 組分試劑加樣過程中,由于移液器、容器、陰性對照及其它試劑被核酸模板或陽性對照污染。

3、 PCR擴增產物污染

這是 PCR 反應中最主要最常見的污染問題。因為 PCR 產物拷貝量大,遠遠高于 PCR 檢測數個拷貝的極限,所以極微量的 PCR 產物污染,就可形成假陽性。還有一種容易被忽視的污染,是能造成 PCR 產物污染形式的氣溶膠污染,而氣溶膠造成的污染是一個值得特別重視的問題。

4、 克隆質粒污染

  在實驗操作中會經常用到陽性參考品,這些參考品大多數是由某些克隆質粒制作而成的,質粒在單位容積內濃度高,不小心使用極易造成污染。 

二、實驗室污染處理方法:

1.物料準備

(1)購買噴壺(能夠噴出霧狀水汽的即可);

(2)購買市面上有效氯消毒片,根據要求配置不同濃度的消毒液,或者購買成品次氯酸鈉消毒液配制合適濃度消毒水;

(3)購買核酸氣溶膠污染清除劑(DNA AWAYO®原液/MediClean⑧稀釋100)

(4)無紡布/無塵紙等。

2.應急處理方法

(1)清理廢液缸并且對廢液缸用有效氯含量為 2000 mg/L 消毒水浸泡消除核酸污染;

(2)用有效氯含量為 2000 mg/L 消毒水對移液槍進行擦洗,關鍵部位為移液槍前端易污染部位,清潔干凈后用潔凈水再擦拭一遍;

(3)將離心管架、擴增管架、擴增管架底板、吸嘴盒及其他相關物品用有效氯含量為 500 mg/L 的消毒水浸泡 2 小時后,用清水沖洗干凈晾干后使用;

(4)對污染區(qū)域內的設備如擴增儀、全自動提取儀等,使用核酸氣溶膠污染清除劑進行反復處理;對生物安全柜等含有空氣過濾系統(tǒng)的設備,需更換過濾網;

(5)用有效氯含量為 500 mg/L 的消毒液對整個實驗室(地板、墻面、天花板、門、窗戶等地方)進行清潔,并且用用有效氯含量為 1000 mg/L 的消毒水對實驗室進行噴霧消毒(重點部位為操作區(qū)),有效降解空氣中的氣溶膠與附著在實驗臺表面的核酸污染;同時加大通風量(內循環(huán)無用,盡可能外循環(huán));

(6)待污染區(qū)域及設備器件清理完成后,常用設備和操作臺面使用移動紫外消毒車近距離輻照 1 小時;實驗室內則使用室內紫外燈整晚輻照。

以上措施每日進行,直至污染消除;步驟 (1) ~ (6) 必須堅持每天進行,確保消除實驗室污染;

3.消除污染判定標準

設計陰性對照組,根據陰性對照確認污染情況??墒褂贸ㄩ_后隔夜放置操作區(qū)的陰性對照進行實驗(在單獨的實驗室驗證),若連續(xù)三天陰性對照沒有起跳,則說明污染得到控制,可恢復正常實驗。

污染,是 PCR 實驗室出現實驗假陽性、結果不可信、研發(fā)不可靠的重要推手。

在最初開展 PCR 實驗室的時候,應最大程度的降低可能出現的 PCR 污染或杜絕污染的出現,在實驗室前期設計及日常實驗室管理和操作中,就需要進行合理的規(guī)劃以及嚴格執(zhí)行實驗室 SOP,把污染的可能性扼殺在搖籃中。

 

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